海南五指山国家级自然保护区位于海南省中部，横跨五指山市和琼中黎族苗族自治县，包括以五指山主峰为中心的广大山区。保护区地理坐标为东经109°32′03″～109°43′19″，北纬18°48′59″～18°59′07″，总面积13435.9公顷，属森林生态系统类型自然保护区，其中核心区面积7290.8公顷，缓冲区面积3895.4公顷，实验区面积2249.7公顷。五指山保护区于1985年经广东省人民政府批准建立省级保护区，2003年经国务院批准晋升为国家级自然保护区。

五指山自然保护区以五指山为中心，主峰由西南向东北排列，其中五指山二峰为最高峰，海拔1867米。保护区地貌类型以山地为主，从中部山体向四周逐级递降，形成一个由山地、丘陵、台地组成的复杂地形地貌体系。五指山保护区属于热带雨林气候，冬暖夏凉，不受寒潮影响，基本反映了热带雨林的气候特点。年平均气温20.5～23.4℃；年降雨量2444mm，年雨日有195天左右，暴雨强度大，土地终年湿润，年平均相对湿度约为90%。保护区内山溪水沟呈现网状分布，水资源十分丰富，五指山是海南三大江河中的万泉河、昌化江的发源地和分水岭。

五指山自然保护区是海南岛海拔高差大、植被垂直带谱完整、热带植被类型多、雨林群落典型的自然保护区之一。保护区以保护原始热带雨林生态系统、珍稀动植物资源及其栖息地为主。保护区记录有野生维管束植物2146种，其中蕨类植物31科85属216种，种子植物177科825属1930种（含变种、亚种及变型）。国家一级重点保护野生植物有坡垒、台湾苏铁，国家二级重点保护野生植物有海南粗榧、刺桫椤、皱皮油丹、石碌含笑等。保护区记录的陆栖脊椎动物有27目75科289种，其中两栖纲2目6科28种，爬行纲2目13科56种，鸟纲16目36科159种，哺乳纲7目20科46种；鱼类有6目18科52属67种（含亚种）；昆虫则有1700余种。国家一级重点保护野生动物有云豹、海南孔雀雉、海南山鹧鸪、圆鼻巨蜥、金斑喙凤蝶等，国家二级重点保护野生动物有黑熊、猕猴、白鹇等。