浙江凤阳山—百山祖国家级自然保护区位于浙江省丽水市的龙泉市南部及庆元县东北部。保护区地理坐标为东经119°06′00″～119°19′20″，北纬27°37′45″～27°58′00″，总面积26051.5公顷，属森林生态系统类型自然保护区，其中核心区面积7436.1公顷，缓冲区面积4152.5公顷，实验区面积14462.9公顷。1975年浙江省政府批准建立凤阳山省级自然保护区，1985年建立了百山祖省级自然保护区，1992年经国务院批准，将两个省级自然保护区合并建设且晋升为“浙江凤阳山—百山祖国家级自然保护区”。

凤阳山—百山祖自然保护区地处我国东南沿海的闽浙丘陵区，由福建武夷山脉向东伸展而成，地貌类型为深切割中山，以侵蚀地貌为主。保护区为亚热带湿润季风气候，属“南岭闽瓯中亚热带”气候区，有明显的湿热同季现象，主要特点是气候温暖湿润、雨量充沛、相对湿度大、雾日多。保护区地表水系发达，河流呈放射状，分属瓯江水系、闽江水系和赛江水系。

凤阳山—百山祖自然保护区主要保护对象为典型的中亚热带湿润性常绿阔叶林森林生态系统、珍稀野生动植物资源和独特的自然景观。据调查统计，保护区内有苔藓植物66科170属368种，蕨类植物37科82属236种，裸子植物9科32属63种，被子植物164科796属1942种，真菌12目37科97属256种。国家一级重点保护野生植物有百山祖冷杉、南方红豆杉等5种，国家二级重点保护野生植物有白豆杉、长叶榧、黄杉、福建柏等21种。保护区内共有各种脊椎动物共26目74科254种，其中两栖爬行类5目16科81种，鸟类13目34科132种，兽类8目23科62种。国家一级重点保护野生动物有黄腹角雉、黑麂、白鹳、云豹等7种，国家二级重点保护野生动物有黑熊、白鹇、赤腹鹰等47种。