内蒙古阿鲁科尔沁国家级自然保护区位于内蒙古自治区阿鲁科尔沁旗东部，距阿鲁科尔沁旗政府所在地天山镇35公里。保护区地理坐标为东经119°55′02″～120°41′27″，北纬43°48′30″～44°28′31″，总面积136793.63公顷，属草原生态系统类型自然保护区。其中核心区面积48989.75公顷，缓冲区面积42320.85公顷，实验区面积为45483.03公顷。阿鲁科尔沁保护区建立于1998年，2005年经国务院批准晋升为国家级自然保护区。
内蒙古阿鲁科尔沁自然保护区地处科尔沁沙地北缘，以风沙地貌为主，属暖温带半干旱气候，春季干旱而多大风，夏季温热而少雨，秋季低湿霜早，冬季寒冷少雪。由于干旱少雨与频繁大风在时间上的同步性以及地表沙质沉积物和年降水量的不稳定性等自然因素的影响，使得这里的生态环境十分脆弱。
内蒙古阿鲁科尔沁自然保护区是一个以保护沙地草原、林地以及河流、湖泊、沼泽湿地等多样的生态系统及珍稀鸟类为主的综合性自然保护区。保护区内共有野生维管束植物63科186属271种，其中药用植物198种；优良牧草38种；观赏植物13种；食用植物23种。该区域是我国北方重要的候鸟迁徙通道和驿站，野生鸟类资源丰富，有鸟类14目37科151种，其中国家一级重点保护野生鸟类有丹顶鹤、大鸨、遗鸥等3种；国家二级重点保护野生鸟类有燕隼、红隼、草原雕、大天鹅等28种。保护区有野生哺乳动物6目13科30种，鱼类3目5科13种，昆虫类19目134科616种。此外，还有众多的菌类资源和水生生物资源。