山西芦芽山国家级自然保护区地处晋西北吕梁山脉的北端，宁武、五寨、岢岚三县交界处。保护区地理坐标为东经111°50′～112°5′30″，北纬38°35′40″～38°45′，总面积21453公顷，属森林和野生动物类型自然保护区。其中核心区面积6122公顷，缓冲区面积1260公顷，实验区面积为14071公顷。芦芽山保护区建立于1980年12月，1997年12月经国务院批准晋升为国家级自然保护区。
山西芦芽山国家级自然保护区属暖温带半湿润山区气候，气候垂直变化明显，高山区可达到寒温带气候标准。区内峰峦重叠，沟壑纵横，森林茂密，植被丰盛，是我国暖温带残存的天然次生林分布区中保存较完整的地区之一，素有“云杉之家，华北落叶松故乡”的称誉，也是三晋母亲河，黄河第二大支流-汾河的源头地区，在华北地区黄土高原上素有“绿色明珠”的美称，具有很高的保护价值。
山西芦芽山自然保护区是以保护世界珍禽-褐马鸡为主的野生动物和以云杉、华北落叶松为主的天然次生林植物群落的综合性自然保护区。现已查清保护区内共有高等植物4门102科429属950种，其中苔藓植物7科8属8种；蕨类植物11科16属25种；种子植物84科405属917种。菌类资源75种，著名的食用菌有雷蘑、羊肚菌等；贵重的药用菌有猴头、猪苓等；还有种类繁多的苔藓、地衣植物。其中，国家二级重点保护野生植物有水曲柳、甘草等共计12种。区内已查清的野生动物有25目74科300种，其中哺乳类有6目15科38种，鸟类有16目52科248种，爬行类有2目5科10种，两栖类有1目2科4种。属于国家一级重点保护野生动物有褐马鸡、黑鹳、金雕、胡兀鹫、大鸨、金钱豹、原麝7种；属于国家二级重点保护野生动物有石貂、青鼬等31种。